לטענת ראש העירייה דוד אבן צור, למרות שהחברה חויבה לשלם לעירייה ארנונה, היא משתמשת בקלף הביטחוני כדי להימנע ממדידה שתאשר את היקף הבינוי בתחומם; זאת למרות החלטת משרד הפנים שקבעה ב-2018 כי העיריות יוותרו על תשלומי ארנונה לרפאל, תמורת כמה מיליוני שקלים בשנה